TIBBI MIKROBIYOLOJI ANABILIM DALI İHTİYACINA 1 KALEM LABORATUVAR MALZEMELERİ

	Adı Soyadı veya Ünvanı: Adresi Telefon - Fax No. : E-Mail: Firma Tanımlayıcı No		Teklif Veren Firma veya kişinin

 

 

 

TALEP ADI :   (3738)TIBBI MİKROBİYOLOJİ ANABILIM DALI İHTİYACINA 1 KALEM LABORATUVAR MALZEMELERİ / 150.03.04 ALIMI

[DÖNER SERMAYE]

TALEP TARİHİ : 05.07.2019

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI

TEKNİK şartname

1. Dideoksi floresan işaretleyici seti, PCR ile elde edilmiş DNA’nın nükleotid/baz dizisinin belirlenmesinde kullanılmak üzere üretilmiş olmalıdır.

2.  Kit, tek zincir veya çift zincir DNA kalıplarının sekanslanması için gerekli tüm reaktifleri içermelidir. Sadece DNA kalıbı ve spesifik primeri eklemek yeterli olmalıdır.

3.  Baz dizilemede kullanılması amacıyla temin edilecek floresan işaretleyici mix/karışım kullanıma hazır olmalı ve bileşiminde;

-  dATP , dGTP, dCTP ve dTTP nükleotidler,

-  Farklı renkte floresan veren kimyasallarla işaretlenmiş ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP dideoksinükleotidler,

-  DNA polimeraz enzimi bulunmalıdır

4.  Kitin içinde çalışma için optimize edilmiş tamponu en az 10 kez sulandırıma yetecek miktarda bulunmalıdır.

5.  Karışım, 488 ve 514.5nm dalga boyu ve ışığı otomatik olarak ayarlayabilen cihazla çalışmaya uygun olmalıdır.

6.  Kit içerisinden çıkan kontrol DNA’sını 750 bazı kayıpsız olarak 98.5% basecalling doğruluğu niteliğinde dizileme performasına sahip olmalıdır.

7.  Kitin içindeki tüm reaktifler ABI marka 3130 xl model Genetik Analizör cihazında kullanılmaya uygun olmalıdır.

8.  Kiti oluşturan malzeme orijinal ambalajları içinde olmalı; ambalajların üzerinde isim, marka, raf ömrü, son kullanma tarihi açıkça belirtilmiş olmalıdır.

9.  Beraberinde cihaz için uygun 20 adet 96-well plak verilmelidir.

10.  Laboratuvara kuru buz içinde teslim edilmelidir.

11.  Kit ile birlikte 20 kutu 10 (XL-ekstra uzun uçlu), 20, 200, 1000 mikrolitre DNase-RNase-free filtreli pipet ucu verilmelidir.

12.  Laboratuvara teslim edildiğinde en az 1 yıl miyadlı olmalıdır.

5.  POP 7 Polimer, 1536 örnek

1. ABI marka 3130xl model Genetik Analizör cihazında kullanılmak üzere üretilmiş olmalıdır.

2.  384 örneklik ambalajda (poşet) bulunmalıdır.

3.  Laboratuvara teslim edildiğinde en az 1 yıl miyadlı olmalıdır.

4.  Prosedür için gerekli 40 adet 96-well plak ve well kapatıcısı (8 well’lik strip) ile yeterli miktarda 10xSequence Buffer kitlerle birlikte verilmelidir.

6.  BigDye XTerminator Cyclesequencing PCR Pürifiksyon Kiti, 1000 reaksiyon

1.  Kit, dideoksi floresan işaretleme amaçlı ‘cyclesequencing PCR’ sonrası reaksiyon tüpündeki ürünün artık floresan boya vb.’den temizlenmesi için spesifik olarak üretilmiş olmalıdır.

2.  Kit, ‘cyclesequencing PCR’ sonrası reaksiyon tüpünde arta kalan tuz, floresan boya vb.’ni bağlayarak inaktif hale getiren bir reaktif ile bu reaktifin performansını güçlendiren bir solüsyonu içermelidir.

3.  Kit prosedüründe; reajenlerinin eklenmesi, vorteks ve ‘spin-down’ santrifüj basamaklarından başka ek reajen ve basamağa gerek olmamalıdır.

4.  20 mikrolitre hacimli 1000 reaksiyon için yeterli miktarda olmalıdır.

5.  Kit ile birlikte prosedür için gerekli;

a.  200 mikrolitre kapasiteli, moleküler testler için uygun,

‘wide-bore/geniş çaplı uç kısım’ özelliği bulunan 1000 adet pipet ucu verilmelidir.

b.  ABI 3130 xl Genetic Analyzer cihazı için uygun 96 kuyulu 40 adet plak verilmelidir.

c.  Plak ile tam uyumlu şeffaf-renksiz yapışkanlı plak kapatıcı film (100 adetlik bir kutu) verilmelidir.

6.  Kit teslim edildiğinde en az bir yıl miyadı olmalıdır.

7.  Maya/Bakteri ekstraksiyon kiti, 200 mililitre

K.MARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA HASTANESİ

Sayfa : 3 / 4 TALEP NO: 3738

TALEP ADI :   (3738)TIBBI MİKROBİYOLOJİ ANABILIM DALI İHTİYACINA 1 KALEM LABORATUVAR MALZEMELERİ / 150.03.04 ALIMI

[DÖNER SERMAYE]

TALEP TARİHİ : 05.07.2019

TALEP YERİ : MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI TEKNİK ŞARTNAME

1. Maya ve bakteri hücrelerinden genomik DNA’nun ekstraksiyonu için özel üretilmiş olmalıdır.

2.  Maya ve bakteri lizisi için gerekli tüm enzim ve tampon çözelti kit içeriğinde bulunmalı; ek malzeme gerektirmemelidir.

3.  Prosedür için gerekli >%99 saflıkta izopropanol kit ile birlikte verilmelidir.

4.  Laboratuvara teslim edildiğinde en az 1 yıl miyadlı olmalıdır.

8.  Primer

1.  50 nanomol konsantrasyonda olmalıdır.

2.  HPLC ile saflaştırılmış olmalıdır.

3.  Dizileri ve isimleri aşağıda belirtilmiştir:

JA230: CTA CCA TCA TGG CTA ARA AYG AGG T JA233: ATG ATG TTA TGA GCT CCA RGT CRT A JA231: TAT GAY ACC CGC TGY TTT GAC JA232: CCT GGT CAT AGC CTC CGT GAA HCV-PR1: CTC AGG CCT ATT GGC CTG GAG HCV-PR3: TAT GAY ACC CGC TGY TTT GAC TC HCV-PR5: GCN GAR TAY CTV GTC ATA GCC TC Oligo d(A): AAA AAA AAA AAA AAA AAA AA

6069-F: GAG GGG GCA GTG CAA TGG ATG AAY MGI YTI ATI GCI TTY GC

7542-R: GAG ATC CGG ATC CCC AGG YTC ICC YTC IAGIGG IGG CATIGA

7541-R: AAG TCC GGG TCA CCG GGG TCC CCY TCW ARY GRA GGC WTT GA

6105-F: TTC GCC TCC CGG GGG AAC CAY GTI TCI CCI ACI CAY TAY GT

6102-GT2-F: GCC TTC GCC TCC CGG GGG AAC CAY GTY GCC CCI ACI CAY TAY GT

6852-R: CAC GGC TAC GTC CGG TTC IGG ITC RCA IGG IAG YTG IGA YCC

6854-GT2-R: CAA CAC GGC TAC GTC CGG TTC AGG ITC RCA RGG RAG YTG IGA ICC

NS5A-Seq-F: TTC GCC TCC CGG GGG AAC

NS5A-Seq-R: CAC GGC TAC GTC CGG TTC

IGS1-26SF: ATC CTT TGC AGA CGA CTT GA

IGS1-26SBF: AGC TGC TGC CAA TGC TAG CTC

IGS1-5SR: AGC TTG ACT TCG CAG ATC GG

TRF: AGA GGC CTA CCA TGG TAT CA

TRR: TAA GAC CCA ATA GAG CCC TA

4.  Primerler ile birlikte teslim edilecek analiz raporlarında saflaştırma yöntemi, üretim analiz raporu, primer konsantrasyonu, Tm sıcaklığı, nükleotid dizis

K.MARAŞ SÜTÇÜ İMAM ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA HASTANESİ

Sayfa : 4 / 4

2.                                                                    KOMİSYON ÜYESİ 3. KOMİSYON ÜYESİ 4. KOMİSYON ÜYESİ  5. KOMİSYON ÜYESİ

İSİM - ÜNVANI - İMZASI İSİM - ÜNVANI - İMZASI İSİM - ÜNVANI - İMZASI İSİM - ÜNVANI - İMZASI